میزبان های طبیعی ویروس پیچیدگی برگ کنجد یک تِرنکِرتوویروس جدید از مزارع کنجد استان کرمان
XML
نویسندگان
1کرمان-بزرگراه امام خمینی-میدان پژوهش-دانشگاه شهید باهنر
2بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
جنس Turncurtovirus با سازمان ژنومی منحصربفرد، یکی از جنس های نه گانه خانواده Geminiviridae است و اعضای آن توسط زنجرک Circulifer haematoceps (Cicadellidae) به روش پایا و گردشی منتقل می‌شوند. تنها گونه قطعی این جنس، ویروس پیچیدگی برگ شلغم (Turnip curly top virus, TCTV) می‌باشد که در سال 2010 از مزارع شلغم استان فارس گزارش گردید. اخیرا یک تِرنکِرتوویروس جدید با استفاده ار تلفیق دو روش آر سی اِ و پی سی آر از زنجرک های C. haematoceps از مناطق ارزوئیه، جیرفت و سیرجان (استان کرمان) جداسازی شده است ولی تاکنون هیچ میزبان گیاهی برای آن گزارش نشده بود. در همین راستا، تلاش هائی برای ردیابی این تِرنکِرتوویروس جدید در طبیعت صورت گرفت. بدین منظور، نمونه‌های مختلفی از گیاهان زراعی شهرستان‌های جیرفت، بم و کرمان با علائم پیچیدگی، بدشکلی، قاشقی شدن برگ و زردی جمع‌آوری گردید و سپس استخراج دی‌ اِن‌ اِ با روش CTAB انجام شد. بررسی آلودگی نمونه‌ها به ویروس فوق با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی و واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام شد و آلودگی گیاهانی شامل کنجد، باقلا، لوبیا، اسفناج، جعفری، تربچه و یونجه به ویروس فوق با تکثیر قطعه 1500 جفت بازی تایید شد. ژنوم کامل یک جدایه کنجد توسط آنزیم فی‌دی‌اِن‌اِ پلی‌مراز به روش دایره غلتان تکثیر و بعد از همسانه سازی، تعیین ترادف گردید. نتایج حاصل از تعیین ترادف نوکلئوتیدی طول ژنوم کامل نشان داد که این جدایه حداکثر به میزان 5/65 درصد با سایر جدایه های TCTV واقع در بانک جهانی ژن شباهت دارد. بنابراین این ویروس به عنوان یک گونه جدید از جنس Turncurtovirus معرفی می گردد و با توجه به گسترش آن در مزارع کنجد بطور موقت ویروس پیچیدگی برگ کنجد نامگذاری می گردد. نتایج این تحقیق نشان می دهد که تِرنکِرتوویروس‌ها دارای تنوع ژنتیکی بسیار زیادی در ایران می باشند.
کلیدواژه ها
موضوعات
 
Title
Natural hosts of sesame curly top virus a new turncurtovirus from sesame growing farms in Kerman province
Authors
parisa hassan sheikhi, Jahangir Heydarnejad, Vahid Hasanvand, Hossain Massumi
Abstract
The genus Turncurtovirus have a unique genome organization and is one of the nine genera in the family Geminiviridae. Turncurtoviruses are transmitted by the Circulifer haematoceps (Cicadellidae) in a persistent and circulative manner. Turnip curly top virus (TCTV) is the only definitive member of the genus which was first reported in turnip growing farms in Fars province in 2010. Recently, a new turncurtovirus was recovered from C. haematoceps collected from Orzoeiyeh, Jiroft and Sirjan (Kerman province) using combination of rolling circle amplification (RCA) and PCR, however, no natural plant host has been already identified for the virus. To detect the virus in natural plant hosts, leaf samples of different crops showing leaf curling with cup-shaped, malformation and yellowing symptoms were collected in Jiroft, Bam and Kerman and total DNA was extracted using CTAB method. The viral infection of the samples was tested by PCR using specific primer pair and 1500 bp in length amplicon was detected for sesame, faba bean, spinach, bean, parsley, radish and alfalfa. Full-length genome of a sesame isolate was amplified using RCA method, cloned and sequenced. Nucleotide sequence comparison showed that the sesame isolate of the virus is most similar to TCTV in GenBank (% 65.5 nucleotide identity). Therefore, the recovered virus from leafhopper is a new member of the genus Turncurtovirus and due to distribution of the virus in sesame farms the putative name sesame curly top virus was provisionally proposed. According to the results of this study, turncurtoviruses have a high genetic diversity in Iran.
Keywords
Geminiviridae, Turncurtovirus, sesame, New species