گزارش جدید از یک گونه Phytopythium برای فلور اوومیستی ایران

کد مقاله : 1183-23IPPC
نویسندگان
بلوار دانشگاه(جاده سرو)، دانشگاه ارومیه، دانشکده کشاورزی، گروه گیاهپزشکی
چکیده
جنس Phytopythium یک آرایه‌ی تک‌تبار از تیره‌ی Peronosporaceae با مشخصات ریخت‌شناختی حدّ واسط بین دو جنس Pythium و Phytophthora می‌باشد. این جنس که در سال‌های اخیر معرفی شده است، شامل گونه‌هایی می‌باشد که اغلب آنها قبلاً در جنس Pythium طبقه‌بندی شده بودند. برخی از گونه‌های این جنس پراکنش جهانی دارند و در اکوسیستم‌های مختلف خشکی و آبی در مناطق گرمسیری، معتدل و سردسیر یافت می‌شوند. برخی گونه‌ها دارای زندگی پوده‌رُستی در محیط‌های طبیعی هستند امّا تعدادی از آنها از جملهPp. helicoides و Pp. vexans بیمارگرهای گیاهان می‌باشند که در شرایط محیطی مناسب باعث ایجاد پوسیدگی ریشه و ساقه می‌شوند. بنابراین با توجه به خسارت قابل توجه برخی گونه‌ها به محصولات زراعی و گلخانه‌ای، Phytopythium از نظر کشاورزی نیز یک جنس مهم محسوب می‌شود. به منظور شناسایی آرایه‌های Phytopythium در مناطق مرکزی استان آذربایجان غربی، طی سال‌های 95 و 96 از خاک‌های این مناطق نمونه‌برداری به عمل آمد. جداسازی از طریق طعمه‌گذاری در خاک و کشت طعمه‌ها در محیط کشت انتخابی صورت گرفت و خالص‌سازی جدایه‌ها از طریق برداشتن نوک ریسه‌های رشد کرده روی آب-‌آگار دو درصد و انتقال آنها به محیط کشت آرد ذرت-آگار انجام گرفت. شناسایی گونه‌ها ابتدا بر اساس خصوصیات ریخت‌شناختی اندام‌های جنسی و غیر‌جنسی و از طریق کشت جدایه‌ها در تشتک‌های پتری حاوی آب و قطعات برگ گندمیان اتوکلاو شده انجام شد. همچنین به منظور تایید نتایج بررسی‌های ریخت‌شناختی و شناسایی دقیق‌تر گونه‌ها، نواحی ITS1-5.8S-ITS2 و بخشی از ژن COXI میتوکندریایی در جدایه‌های منتخب تکثیر و توالی‌یابی گردید و روابط فیلوژنتیکی آنها با گونه‌های شناخته شده این جنس مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس مشخصات ریخت‌شناختی و بررسی‌های فیلوژنتیکی توالی‌های DNA، سه گونه Pp. vexans، Pp. ostracodes و Pp. carbonicum شناسایی شد که Pp. ostracodes آرایه‌ی جدید برای فلور اوومیستی استان آذربایجان غربی وPp. carbonicum آرایه‌ی جدید برای فلور اوومیستی ایران می‌باشد.
کلیدواژه ها
موضوعات
 
Title
New record of a Phytopythium species for oomycete flora of Iran
Authors
sevda Rezaei
Abstract
Phytopythium is a monophyletic genus of the Peronosporaceae and morphologically is intermediate between Pythium and Phytophthora. Most members of this recently established genus have already been classified in Pythium. Several species of Phytopythium are distributed worldwide and are found in various water and terrestrial ecosystems of tropical, temperate and cold regions. Some species are saprobes in natural environments but a few taxa such as Pp. helicoides and Pp. vexans are well known as plant pathogens causing root and stem rot under conducive conditions. Therefore, considering the damage of some species to field and greenhouse crops, Phytopythium is considered as an agriculturally important genus. To identify Phytopythium species in central regions of West Azarbaijan province, soil samples were collected from these regions in 2016 and 2017. Isolation was performed using baiting technique and baits were cultured in selective medium. The isolates were purified by taking hyphal tips growing on 2% water-agar and transferring them onto cornmeal agar. Morphological identification was performed by culturing the purified isolates in sterile distilled water containing autoclaved wheat leaves and examining morphological characters of asexual and sexual organs. Furthermore, to confirm the results of morphological studies and more precise identification of the species, ITS1-5.8S-ITS2 regions and partial mitochondrial COXI gene in the isolates were amplified and sequenced and, their phylogenetic relationships with described species of the genus were investigated. Based on the morphological characters and phylogenetic analyses of DNA sequences, three species including Pp. vexans, Pp. ostracodes and Pp. carbonicum were identified. Among the identified species, Pp. ostracodes is new for West Azarbaijan province and Pp. carbonicum is new for oomycete flora of Iran.
Keywords
Fungus-like, taxonomy, morphology, Phylogeny