ویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی یک مستری ویروس پلی فاژ و آلوده کننده گیاهان زراعی و سبزیجات در ایران
کد مقاله : 1360-23IPPC
نویسندگان
1کرمان- خیابان آبنوس- کوچه ی 28
2هیئت علمی، بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
3بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
476169-14111
چکیده
ویروس کوتولگی سبزرد نخود ایرانی (Chickpea chlorotic dwarf virus, CpCDV) از جنس Mastrevirus و خانواده Geminiviridae یکی از ویروس های مهم گیاهان لگوم و برخی دیگر از گیاهان زراعی است. در این تحقیق، شیوع این ویروس در چند گیاه زراعی و سبزیجات مختلف که از مناطق شرقی و جنوبی ایران شامل استان های کرمان، فارس، خراسان رضوی و خراسان شمالی جمع آوری شده بودند با استفاده از آزمون های الایزا و پی سی آر مورد مطالعه قرار گرفت. در ابتدا با استفاده از آزمون الایزای غیر مستقیم و آنتی سرم پلی کلونال CpCDV آلودگی انواع بقولات شامل نخود ایرانی، لوبیا چشم بلبلی، عدس، لوبیا، باقلا، یونجه، شبدر، اسپرس و شنبلیله و چندین گیاه خارج از خانواده لگومینوزه شامل طالبی، کدو، گوجه فرنگی، هندوانه، شلغم، فلفل دلمه ای، فلفل قلمی، چغندرقند، اسفناج، بادمجان، گیشنیز، شوید، ریحان، شاهی، کاهو، جعفری و گل داوودی با علائم مشخص آلودگی به جمینی ویروس ها شامل کوتولگی، زردی حاشیه برگ ها، چروکیدگی سطح برگ و/یا پیچیدگی برگ ها به این ویروس اثبات گردید. سپس دی اِی اِی گیاهان فوق استخراج شده و آلودگی آن ها به CpCDV در آزمون پی سی آر با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی تائید گردید. از میان نمونه هائی که آلودگی آن ها به CpCDV اثبات شده بود یک جدایه از گیاه عدس (15) که از منطقه رابر در استان کرمان جمع آوری شده بود انتخاب و کامل ژنوم آن به روش دایره غلطان و با استفاده از کیت آر سی اِ (TempliPhi, GE Healthcare, USA) تکثیر گردید. محصول بدست آمده در ناقل pGreen همسانه سازی شده و سپس تعیین ترادف گردید. بررسی ترادف بدست آمده نشان داد که جدایه رابر بیشترین شباهت را به میزان 99-97 درصد به جدایه هائی از کشورهای عمان، یمن و سوریه دارد که قبلا از گیاهان فلفل، عدس و نخود ایرانی گزارش شده است. بر اساس نتایج این تحقیق، CpCDV یک مستری ویروس پلی فاژ و دارای دامنه میزبانی بسیار وسیع حتی در خارج از گیاهان خانواده حبوبات می باشد. آلودگی بسیاری از این میزبان ها به CpCDV برای اولین بار در دنیا گزارش می گردد. تعیین ترادف و تعیین مشخصات ژنوم جدایه های این ویروس از سایر میزبان ها در دست انجام است.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Chickpea chlorotic dwarf virus a polyphagous mastrevirus infecting crops and vegetables in Iran
Authors
farinoosh askari, Jahangir Heydarnejad, sanaz viziri, javad sadeghi-majd, mehdi kamali, Hossain Massumi
Abstract
Chickpea chlorotic dwarf virus (CpCDV, Mastrevirus, Geminiviridae) is a destructive virus of legume crops and several non-leguminous crops. In this research, the CpCDV infection of legume crops, vegetables and ornamental plant collected from Kerman, Fars, Razavi Khorasan and Northern Khorasan provinces in southern and eastern Iran was studied using indirect ELISA and PCR tests. Symptomatic leguminous samples including chickpea, cowpea, lentil, bean, faba bean, alfalfa, clover, sainfoin and fenugreek and several non-leguminous plants namely cantaloupe, zucchini squash, tomato, watermelon, turnip, bell pepper, cayenne pepper, sugar beet, spinach, eggplant, coriander, dill, basil, garden cress, lettuce, parsley and chrysanthemum showing typical geminivirus symptoms, i. e., dwarfing, yellowing of leaf margin, wrinkled leaves and/or mild leaf curling reacted to a polyclonal CpCDV antiserum in indirect ELISA test. The CpCDV infection of positive ELISA samples was confirmed in PCR using specific primer pair. Among CpCDV infected samples, the full-length genome of a lentil isolate (15) from Rabor (Kerman province) was amplified by rolling circle amplification method using TempliPhi (GE Healthcare Kit, USA) and cloned into the pGreen vector followed by sequencing of the genome. Comparison of the nucleotide sequence of the isolate 15 (lentil isolate) showed the maximum identity (97-99%) to pepper, lentil and chickpea isolates from Oman, Yemen and Syria, respectively. According to the results of this study, CpCDV is a polyphagous mastrevirus and has a wide host range in leguminous and even out of leguminous crops. The CpCDV infection of most plant hosts is reported for the first time in the world. Sequencing and genome characterization of additional CpCDV isolates from different hosts are in progress.
Keywords
Chickpea chlorotic dwarf virus, Mastrevirus, Polyphagous, rolling circle amplification