جداسازی و شناسایی گونه های Togniniaceae، Botryosphaeriaceae و Diatrypaceae از درختان انار (Punica granatum) در ایران
کد مقاله : 1286-23IPPC
نویسندگان
1شهداد خیابان طالقانی بلوار شهدای گمنام
2کرمان، بلوار 22 بهمن، میدان پژوهش، دانشگاه شهید باهنر، دانشکده کشاورزی، بخش گیاهپزشکی
چکیده
انار (Punica granatum) یکی از مهمترین محصولات باغی در مناطق نیمه گرمسیری جهان است. در طول سال های 1395 و 1396 یک بررسی بر روی بیماری های قارچی شاخه و تنه درختان انار در باغ های استان های فارس و کرمان انجام گردید. نمونه برداری از شاخه درختان بیمار با نشانه های زردی، شانکر، کم برگی، سرخشکیدگی و زوال صورت گرفت. شاخه های نمونه برداری شده به صورت طولی و عرضی برش داده شدند و نوع تغییر رنگ بافت چوب (نکروز) در آنها مورد بررسی قرار گرفت. نمونه های چوبی دارای تغییر رنگ بافت به قطعات کوچک (3×3 میلی متر) بریده شدند و به مدت 30 ثانیه در هیپوکلریت سدیم 1% ضد عفونی و سپس با آب استریل شستشو داده شدند. حدود 12 تا 15 قطعه چوب از ناحیه بین بافت سالم و آلوده انتخاب و بر روی محیط های کشت عصاره سیب زمینی- دکستروز-آگار (PDA) و یا عصاره مالت-آگار (MEA) کشت داده شدند. همه تشتک های پتری در دمای °C25 نگهداری شدند. شناسایی جدایه های منتخب به روش مولکولی و با تجزیه و تحلیل ناحیه ITS (برای جدایه های Diatrypaceae)، بخشی از ژن بتا توبولین (برای جدایه های Togniniaceae و Diatrypaceae) و بخشی از فاکتور بسط دهنده ترجمه (برای جدایه های Botryosphaeriaceae) انجام گردید. در این بررسی 104 جدایه از Togniniaceae (66 جدایه Phaeoacremonium italicum، یک جدایه Pm. fraxinopennsylvanicum، پنج جدایه Pm. inflatipes و 32 جدایه از یک گونه Phaeoacremonium)، 13 جدایه Botryosphaeriaceae (Lasiodiplodia theobromae) و چهار جدایه از Diatrypaceae (Diatrype whitmanensis) از درختان بیمار جداسازی و شناسایی گردید. در این بررسی گونه های Pm. fraxinopennsylvanicum، Pm. inflatipes، L. theobromaeو D. whitmanensis برای اولین بار از درختان انار در دنیا جداسازی شدند. گونه Pm. italicum تاکنون از ایران گزارش نشده است و این تحقیق اولین گزارش از این گونه برای میکوبیوتای ایران می باشد.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Isolation and identification of Togniniaceae, Botryosphaeriaceae and Diatrypaceae species from pomegranate (Punica granatum) trees in Iran
Authors
somayeh kadkhodahemmatabadi, Hamid Mohammadi
Abstract
Pomegranate (Punica granatum) is an important horticultural crop of the subtropical regions in the word. In 2016 and 2017, a survey of pomegranate fungal trunk pathogens was conducted in some orchards in Fars and Kerman provinces. Branch samples were collected from affected trees exhibiting yellowing, canker, sparse foliage, dieback and decline. Branch samples were cut lengthways and crossways, and inspected for various wood discoloration. Samples with discoloured internal tissues were cut into small discs (3 × 3 mm) and surface disinfected by immersing in 1.0% solution of NaOCl for 30 second and rinsed in sterile distilled water (SDW). Approximately 12-15 wood pieces were taken from the margin between symptomatic and apparently healthy tissue and plated onto potato dextrose agar (PDA) or malt extract agar (MEA) media. All fungal isolates were identified based on morphological and cultural characteristics. All plates were incubated at 25°C. Morphological identifications of the representative isolates were confirmed by sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) nrDNA (for Diatrypaceae isolates), partial β-tubulin gene: BT (for Togninaniaceae and Diatrypaceae isolates) and a partial sequence of the translation elongation factor 1α: EF-1α (for Botryosphaeriaceae isolates). In this study, 104 isolates of Togniniaceae (66 isolates of Phaeoacremonium italicum, one isolate of Pm. fraxinopennsylvanicum, five isolates of Pm. inflatipes and 32 isolates of a Phaeoacremonium sp.), 13 isolates of Botryosphaeriaceae (Lasiodiplodia theobromae) and four isolate of Diatrypaceae (Diatrype whitmanensis) were isolated and identified from affected trees. This study is the first record of Pm. fraxinopennsylvanicum, Pm. inflatipes, L. theobromae and D. whitmanensis on pomegranate worldwide. Pm. italicum has not yet been reported from Iran and the present study is the first record of this species for the Iranian mycobiota.
Keywords
Beta tubulin, trunk diseases, ITS, EF-1&alpha