گونه‌های فوزاریوم مرتبط با چند گیاه دارویی خانواده‌ی Lamiaceae در شمال استان کرمان
کد مقاله : 1269-23IPPC
نویسندگان
1کرمان، انتهای اتوبان هفت باغ علوی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته ۷۶۳۱۸۱۸۳۵۶
2استادیار پژوهش، بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شیراز
چکیده
با توجه به اهمیت گیاهان دارویی در استان کرمان، پژوهشی به منظور شناسایی گونه‌های قارچی مرتبط با ریشه و طوقه گیاهان دارویی چند خانواده گیاهی شاخص از جمله خانواده Lamiaceae در سال 1396 در شمال استان کرمان انجام شد. نمونه‌های ریشه، طوقه و خاک اطراف ریشه از گیاهان دارای علایم پژمردگی، زوال، زردی، کوتولگی و پوسیدگی ریشه جمع‌آوری شد. به منظور جداسازی عوامل قارچی، بخش‌های مختلف گیاه شسته شده، با استفاده از اتانول 95% به مدت 10 ثانیه و هیپوکلریت سدیم 10% تجاری به مدت یک دقیقه سترون-سازی سطحی شدند و پس از شستشو با آب دیونیزه سترون، روی محیط کشت PDA کشت شدند. جدایه‌های مربوط به جنس فوزاریوم جدا شده از قطعات ریشه و ساقه به منظور شناسایی ریخت‌شناختی گونه‌ها، پس از خالص‌سازی روی محیط کشت‌های PDA جهت بررسی ریخت‌شناسی پرگنه (تولید رنگدانه و نرخ رشد) و محیط کشت‌های SNA (Synthetic Nutrient-poor Agar) حاوی کاغذ صافی استریل، KCL (KCL Agar) و CLA (Carnation Leaf Agar) جهت بررسی ویژگی‌های میکروسکوپی (سرهای دروغین، میکروکنیدیوم، ماکروکنیدیوم و کلامیدسپور) کشت شدند. جهت شناسایی ریخت شناسی از توصیف Leslie & Summerell 2006 و کلیدهای شناسایی معتبر (Nelson et al. 1983; Burgess et al. 1988) استفاده شد. شناسایی گونه‌ها نهایتاً با کمک توالی‌یابی ناحیه ژنی TEF1-ɑ و مقایسه توالی‌های حاصل با با توالی‌های موجود در بانک ژن و پایگاه داده‌ی Fusarium MLST تأیید شد. از هر گونه یک جدایه برای بررسی بیماری‌زایی روی میزبان مورد آزمون قرار گرفت. مایه‌زنی به ریشه‌های گیاهان دو الی چهار هفته‌ای در گلخانه با با دانه‌های کلنیزه شده‌ی بلوط با جدایه‌های منتخب صورت گرفت. در این پژوهش در مجموع 65 جدایه فوزرایوم از گیاهان دارای علائم جداسازی شد. تنوع بالایی از گونه‌های فوزرایوم همراه با ریشه و طوقه گیاهان دارویی خانواده‌های Lamiacae مشاهده شد که تعداد زیادی از آن‌ها روی میزبان گیاهی خود بیماری‌زایی نداشتند. گونه‌های Fusarium جدا شده متعلق به کمپلکس‌های گونه‌ای Fusarium solani species complex (FSSC)، Gibberella fujikuroi species complex (GFSC)، Fusarium redolens species complex (FRSC)، Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FEISC)، Fusarium sambucinum species complex (FSSC) و Fusarium tritinctum species complex (FTSC)، Fusarium oxysporum species complex (FOSC) به ترتیب با فراوانی 33، 7/23، 7/5، 7/10، 8/2، 5/16، 5/3 و 5/3 درصد بودند. از میان گونه‌های شناسایی شده که روی میزبان گیاهی خود بیمارگری داشتند، گونه‌های F. solani از ریشه کاکوتی؛ F. avenaceum از ریشه آویشن؛ F. brachygibbosum و F. redolens از ریشه نعنا فلفلی؛ و یک گونه از F.tricinctum species complex از ریشه کلپوره برای نخستین بار از ایران گزارش می‌شوند.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Fusarium species associated with some medicinal plants from Lamiaceae in northern rangelands of Kerman province
Authors
Azadeh Habibi, Banafsheh Safaiefarahani
Abstract
A survey on soilborne fungal flora of some medicinal plants in Lamiacae family were conducted during 2017 in northern parts of Kerman province where medicinal plants are of great value. Samples from different parts of plants showing yellowing, wilting, stunting and root rot were collected. In order to isolate fungal agents, different parts of the plants were washed, surface disinfected 95% EtOH for 10 s, 1% NaOCl for 1 min, then rinsed in deionized H20 for 1 min.and cultured on PDA. Fusarium spp. isolated from root and shoot pieces were then cultured on PDA for colony morphology characteristics as well as SNA (Synthetic Nutrient-poor Agar), KCL (KCL Agar) and CLA (Carnation Leaf Agar) media for microscopic examination of false heads, microconidia, macroconidia and clamidospores. Reliable keys (Nelson et al. 1983; Burgess et al. 1988) and Leslie & Summerell 2006 description were used for morphological identifications. Species identifications were confirmed by sequencing of the elongation factor 1-α (EF1-α) gene region and comparing to sequences in genbank and Fusarium MLST databases. One single spored isolate of each species was tested for pathogenecity on two-four-week old seedlings of host plant inoculated with colonised oat kernels in greenhouse. Isolations were made from roots of inoculated and control plants. In total 65 fusarium isolate were recovered from symptpmatic plants. Fusarium species associated with medicinal plants of Lamiacae family were diverse, however, many of them didn’t cause symptoms on their host plants. Fusarium species belonged to different species complexes including Fusarium solani species complex, Gibberella fujikuroi species complex, Fusarium redolens species complex, Fusarium incarnatum-equiseti species complex, Fusarium sambucinum species complex, Fusarium tritinctum species complex and Fusarium oxysporum species complex with relative frequencies of 33, 23.7, 5.7, 10.7, 2.8, 16.5, 3.5 and 3.5 % respectively. From species that were pathogenic on their hosts, F. solani on Ziziphora tenuior, F. avenaceum on Thymus carmanicus, F. brachygibbosum and F. redolens on Mentha piperita and a species from F.tricinctum species complex on Teucrium polium are being reported for the first time.
Keywords
: Thymus carmanicus, EF1-&alpha, gene, Ziziphora tenuior, Teucrium polium, Mentha piperita