شناسایی گونههای سرکوسپورای مرتبط با بیماری نوظهور لکه برگی سرکوسپورایی لوبیا در استان گیلان بر اساس فیلوژنی چندژنی
کد مقاله : 1497-23IPPC
نویسندگان
استادیار موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور
چکیده
شناسایی گونههای سرکوسپورای مرتبط با بیماری نوظهور لکه برگی سرکوسپورایی لوبیا در استان گیلان بر اساس فیلوژنی چندژنی
لوبیا (Phaseolus vulgaris L.) یکی از مهمترین گیاهان زراعی است که در اکثر مناطق ایران کشت می شود. طی بازدید از مزارع کشت لوبیا در مناطق آستارا، تالش، فومن، صومعه سرا، لاهیجان و کیاشهر در استان گیلان، شیوع گسترده ای از علایم لکه برگی روی این گیاهان مشاهده گردید. به منظور شناسایی عوامل دخیل در این بیماری، از برگ های دارای علایم لکه برگی، نمونه برداری به عمل آمد. کشت های تک اسپور به صورت مستقیم از لکه های برگی تهیه و DNA جدایه های قارچی استخراج گردید. جدایه ها با استفاده از ترکیب خصوصیات ریخت شناختی و توالی شش ناحیه ژنی ITS، tef1، cmdA، his3، actA و gapdh شناسایی شدند. از 21 جدایه قارچی به دست آمده، هشت جدایه به گونه مرکب Cercospora sp. G و 13 جدایه به گونه مرکب Cercospora cf. flagellaris تعلق داشتند. در ضمن گونه های قارچی شناسایی شده، روی یک گیاه و حتی یک لکه برگی به صورت همزمان حضور داشتند. بر اساس منابع موجود، تحقیق حاضر اولین گزارش از وقوع گونه های Cercospora cf. flagellaris و Cercospora sp. G روی گیاه لوبیا در دنیا است. با توجه به اینکه این تحقیق، اولین گزارش از شیوع گسترده بیماری لکه برگی سرکوسپورایی روی گیاه لوبیا در شمال کشور است و گونه های قارچی دخیل در این بیماری از گونه های رایج دخیل در لکه برگی سرکوسپورایی لوبیا در سایر نقاط دنیا تفاوت داشتند، این بیماری می تواند در زمره بیماری های نوظهور حائز اهمیت باشد.
واژگان کلیدی: گونه مرکب، فیلوژنی، قارچ های سرکوسپوروئید.
لوبیا (Phaseolus vulgaris L.) یکی از مهمترین گیاهان زراعی است که در اکثر مناطق ایران کشت می شود. طی بازدید از مزارع کشت لوبیا در مناطق آستارا، تالش، فومن، صومعه سرا، لاهیجان و کیاشهر در استان گیلان، شیوع گسترده ای از علایم لکه برگی روی این گیاهان مشاهده گردید. به منظور شناسایی عوامل دخیل در این بیماری، از برگ های دارای علایم لکه برگی، نمونه برداری به عمل آمد. کشت های تک اسپور به صورت مستقیم از لکه های برگی تهیه و DNA جدایه های قارچی استخراج گردید. جدایه ها با استفاده از ترکیب خصوصیات ریخت شناختی و توالی شش ناحیه ژنی ITS، tef1، cmdA، his3، actA و gapdh شناسایی شدند. از 21 جدایه قارچی به دست آمده، هشت جدایه به گونه مرکب Cercospora sp. G و 13 جدایه به گونه مرکب Cercospora cf. flagellaris تعلق داشتند. در ضمن گونه های قارچی شناسایی شده، روی یک گیاه و حتی یک لکه برگی به صورت همزمان حضور داشتند. بر اساس منابع موجود، تحقیق حاضر اولین گزارش از وقوع گونه های Cercospora cf. flagellaris و Cercospora sp. G روی گیاه لوبیا در دنیا است. با توجه به اینکه این تحقیق، اولین گزارش از شیوع گسترده بیماری لکه برگی سرکوسپورایی روی گیاه لوبیا در شمال کشور است و گونه های قارچی دخیل در این بیماری از گونه های رایج دخیل در لکه برگی سرکوسپورایی لوبیا در سایر نقاط دنیا تفاوت داشتند، این بیماری می تواند در زمره بیماری های نوظهور حائز اهمیت باشد.
واژگان کلیدی: گونه مرکب، فیلوژنی، قارچ های سرکوسپوروئید.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Identification of Cercospora spp. associated with emerging Cercospora leaf spot disease of Phaseolus vulgaris L. in Guilan province based on Multigene phylogeny
Authors
Mounes Bakhshi
Abstract
Identification of Cercospora spp. associated with emerging Cercospora leaf spot disease of Phaseolus vulgaris L. in Guilan province based on Multigene phylogeny
The Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) is one of most important plants, which cultivated in different regions of Iran. In a survey of Common Bean fields in the Astara, Talesh, Fuman, Sowme'eh Sara, Lahijan and Kiashahr regions of Guilan province, the widespread distribution of leaf spot symptoms on this crop were observed. In order to identify the fungal agents associated with this disease, symptomatic leaves were collected in the field and taken to the laboratory. Single spore isolates derived directly from leaf spots and genomic DNA of the isolates was extracted. Isolates were identified based on sequence data of six genomic loci (ITS, actA, tef1, cmdA, his3 and, gapdh), host, and morphological data. Of the 21 isolates obtained in this study, eight isolates were identified as Cercospora sp. G and the remaining 13 isolates nested within Cercospora cf. flagellaris species complex. In addition, the fungal species also detected simultaneously on a plant and even a leaf spot. This is the first report of the Cercospora sp. G and Cercospora cf. flagellaris on Phaseolus vulgaris in the world. Considering that this research is the first report of the widespread distribution of Cercospora leaf spot (CLS) disease of Common Bean in north of the country and the Cercospora species associated with this disease were different from the common Cercospora spp. associated with Cercospora leaf spot of P. vulgaris in other parts of the world, the disease can be considered as an new emerging disease.
Key words: Cercosporoid fungi, phylogeny, species complex.
The Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) is one of most important plants, which cultivated in different regions of Iran. In a survey of Common Bean fields in the Astara, Talesh, Fuman, Sowme'eh Sara, Lahijan and Kiashahr regions of Guilan province, the widespread distribution of leaf spot symptoms on this crop were observed. In order to identify the fungal agents associated with this disease, symptomatic leaves were collected in the field and taken to the laboratory. Single spore isolates derived directly from leaf spots and genomic DNA of the isolates was extracted. Isolates were identified based on sequence data of six genomic loci (ITS, actA, tef1, cmdA, his3 and, gapdh), host, and morphological data. Of the 21 isolates obtained in this study, eight isolates were identified as Cercospora sp. G and the remaining 13 isolates nested within Cercospora cf. flagellaris species complex. In addition, the fungal species also detected simultaneously on a plant and even a leaf spot. This is the first report of the Cercospora sp. G and Cercospora cf. flagellaris on Phaseolus vulgaris in the world. Considering that this research is the first report of the widespread distribution of Cercospora leaf spot (CLS) disease of Common Bean in north of the country and the Cercospora species associated with this disease were different from the common Cercospora spp. associated with Cercospora leaf spot of P. vulgaris in other parts of the world, the disease can be considered as an new emerging disease.
Key words: Cercosporoid fungi, phylogeny, species complex.
Keywords
Key words: Cercosporoid fungi, Phylogeny, species complex