گزارش سیزده گونه از نماتدهای خانواده Longidoridae از استان آذربایجان شرقی
کد مقاله : 1491-23IPPC
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه تبریز
2دانشگاه تبریز، بلوار 29 بهمن، تبریز
3آ. شرقی- صوفیان- رودقات- زین آباد
چکیده
خانوادهLongidoridae شامل حدود 480 گونه از جنسهای Xiphinema، Longidorus، Longidoroides، Paralongidorus، Australodorus، Paraxiphidorus وXiphidorus است. این گروه از نماتدها شامل گونههای کریپتیکی است که اگرچه از لحاظ تبارزایی با یکدیگر متفاوت هستند ولی از نظر ریختشناختی شبیه هماند. بنابراین آرایهبندی مولکولی غیروابسته به ریختشناختی مثل بقیه گروههای نماتدی در این گروه نیز توسعه یافته است. از آنجائیکه گونههای این خانواده انگل گیاهی بوده و از ناقلین نپوویروسهای مهم گیاهی محسوب میشوند، شناسایی آنها از لحاظ مدیریت بیماریهای گیاهی نماتدی و ویروسی و نیز از دیدگاه قرنطینهای حائز اهمیت است. به منظور بررسی گونههای این خانواده، طی سالهای 1395 و 1396 متجاوز از 500 نمونه خاک از فراریشهی گیاهان مختلف آذربایجانشرقی بهطور تصادفی جمعآوری شد، استخراج نماتدها از خاک با روش تغییر یافته برآون و بوآگ انجام و اسلایدهای میکروسکوپی تهیه گردید. بررسی ویژگیهای ریختشناختی و ریختسنجی نمونهها با استفاده از منابع و شناسایی گونهها با کمک کلیدهای معتبر صورت گرفت. در بخش مولکولی DNA نماتدها استخراج و با استفاده از پرایمرهای نواحی ژنی ITS1 rDNA و D2-D3 28S rDNA تکثیر و توالییابی انجام شد و رسم درخت نسبزایی با استفاده از نرمافزارهای مناسب صورت گرفت. در این تحقیق پنج گونه از X. americanum groupبه نامهای X. simile، X. pachtaicum، X americanum، Xiphinema sp.1 و Xiphinema sp.2. چهار گونه از Longidorus شامل L. apulus، L.proximus،iranicus L. و L. persicus و چهار گونه X. aceri، X. ingens، X. vuittenezi و X. index از Xiphinema non americanum group شناسایی شدند. از بین گونههای فوق X. aceri و X. simile قبلا از ایران گزارش نشده است و Xiphinema sp.1 با احتمال پسین (PP) 62/0 و 65/0 به ترتیب از X. astaregiensie و X. plesiopachtaicum در تبارنما متمایز میگردد و Xiphinema sp.2 نیز با وجود قرار گرفتن در خوشه مرتبط به جدایههای X. chambersi بهدلیل طول شاخه بلندتر و با احتمال پسین 99/0 به احتمال زیاد از آن متفاوت است. بهجز X. ingens،L. iranicus و L. persicus برای سایر گونهها، از ایران توالی ژنی در بانکژن وجود ندارد و همچنین برای اولینبار توالی نوکلئوتیدی تکثیر شده با پرایمر D2-D3 برای X. aceri و توالی تکثیر شده با پرایمرهای D2-D3 و ITS1 برای L. proximus در بانک ژن درج میشود.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Thirteen species of Longidoridae family from East Azarbaijan province, Iran
Authors
arezoo naghavi, Gholamreza Niknam, nasir vazifeh zeinabad
Abstract
The Longidoridae family consists of nearly 480 species belonging to different genera including Xiphinema, Longidorus, Longidoroides, Paralongidorus, Australodorus, Paraxiphidorus and Xiphidorus. This group of nematodes include cryptic species that are morphologically indistinguishable but phylogenetically different from each other. Therefore, as in other nematode groups, molecular procedures have also been developed in this group of nematodes. Since the species of this family are important plant parasitic nematodes and considered as vectors of well-known Nepoviruses, their accurate identification is important in terms of the management of viral plant diseases as well as adopting the quarantine measures. In order to study the species of this family, more than 500 soil samples were randomly collected from the rhizosphere of various plants from East Azarbaijan province during 2016 and 2017. The extraction of nematodes was performed using modified Brown and Boag’s method and microscopic slides prepared. Morphological and morphometric characteristics of the specimens were studied using the literature and the identification of species was carried out based on valid keys. In the molecular section, the DNA of the nematodes was extracted and amplified by the primers related to ITS1 rDNA and D2-D3 28SrDNA, regions. The resulting fragments were sequenced and drawing of the phylogenetic tree was done using appropriate software. In this research, five species of X. americanum group namely, X. simile, X. pachtaicum, X.americanum, Xiphinema sp.1 and Xiphinema sp.2, four species of Longidorus including L. apulus, L. proximus,L.iranicus and L. persicus and four species, X.aceri, X. ingens, X. vuittenezi and X. index of Xiphinema non- americanum group were identified. Among the species mentioned above, X. aceri and X. simile have not previously been reported from Iran, and Xiphinema sp.1 is distinguished from X. astaregiensie and X. plesiopachtaicum with the posterior probabilities (PP) of 0.62 and 0.65 as in phylogenetic tree, respectively. Xiphinema sp.2 is also likely to be different, despite being in the associated cluster of the X. chambersi isolates, due to the length of the branch and the posterior probability of 0.99. Except X. ingens, L. iranicus and L. persicus for other species, there is no gene sequencing in Gene bank from Iran, and for the first time, the nucleotide sequence amplified with D2-D3 primer for X. aceri and the sequence amplified with D2-D3 and ITS1 primers for L. Proximus is deposited in the Gene bank.
Keywords
morphology, morphometry, Longidorus, Xiphinema