آنالیز فیلوژنتیکی، میزبان های طبیعی و انتقال ویروس مرتبط با کوتولگی زرد تلخه بیان
کد مقاله : 1571-23IPPC
نویسندگان
پریسا حسن شیخی 1 ، جهانگیر حیدرنژاد2 ، وحید حسنوند3 ، صدیقه باقری3 ، جواد صادقی مجد3 ، افسانه آویش کوهشاهی3 ، نجمه پورامینی3 ، حسین معصومی2
1کرمان-بزرگراه امام خمینی-میدان پژوهش-دانشگاه شهید باهنر
2هیئت علمی، بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
3بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
ویروس مرتبط با کوتولگی زرد تلخه بیان (sophora yellow stunt associated virus, SYSaV) یک نانوویروس جدید است که سال گذشته برای اولین بار از استان کرمان گزارش شد. در این بررسی، یک جدایه جدید ویروس از گیاه تلخه بیان (H13) از غرب ایران (استان کرمانشاه، هرسین) جمع آوری شد و بعد از استخراج دی اِن اِ از بافت گیاه آلوده، هشت قطعه ژنومی ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی و تلفیق روش های پی سی آر و تکثیر به روش دایره غلطان (آر سی اِ) تکثیر گردیدند. قطعات تکثیر شده به اندازه تقریبی یک کیلو باز در ناقل pTG همسانه سازی و سپس تعیین ترادف شدند. آنالیز فیلوژنتیکی ترادف های بدست آمده نشان داد که قطعات مختلف ژنوم این ویروس حداکثر 72% با ژنوم سایر نانوویروس ها شباهت دارند. علاوه بر این، جدایه H13 با جدایه قبلی این ویروس موجود در بانک ژن بین %92-97 درصد با یکدیگر شباهت دارد. مطالعاتی که به منظور تعیین سایر میزبان های طبیعی این ویروس با استفاده از آزمون پی سی آر و تعیین ترادف برخی از قطعات ژنومی ویروس شامل قطعات DNA-R، DNA-N و DNA-C نشان داد که علاوه بر گیاه تلخه بیان، گیاهان نخود، عدس، شیرین بیان (Glycyrrhiza glabra L.) و اسفند (Peganum harmala L.) با علائم کوتولگی و زردی نیز توسط این ویروس در طبیعت آلوده می شوند. علاوه براین، تمامی قطعات دارای سیگنال polyadenylation می باشند. به منظور تعیین ناقل این ویروس، شته های Aphis craccivora و Acyrthosiphon pisum بعنوان ناقلین عمده سایر نانوویروس ها در شرایط گلخانه برای انتقال SYSaV مورد مطالعه قرار گرفتند. نتایج بدست آمده نشان داد که هر دو گونه شته قادر به انتقال ویروس هستند. از آنجا که گیاه تلخه بیان میزبان مناسبی برای شته A. craccivora نمی باشد به نظر می رسد که شته نخود فرنگی (A. pisum) ناقل اصلی ویروس باشد. بر اساس نتایج این تحقیق، SYSaV یکی از نانوویروس های آلوده کننده گیاهان خانواده Fabaceae در ایران می باشد.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Phylogenetic analysis, natural hosts and transmission of sophora yellow stunt associated virus
Authors
parisa hassan sheikhi, Jahangir Heydarnejad, Vahid Hasanvand, Sedigheh Bagheri, javad sadeghi-majd, Afsaneh Avish-Koohshahi, Najmeh Pouramini, Hossain Massumi
Abstract
Sophora yellow stunt associated virus (SYSaV) was recently reported as a new nanovirus in Kerman province. In this study, a new isolate of the virus (H13) was collected from Harsin (Kermanshah province) and total DNA was extracted followed by amplification of eight genomic components using combination of PCR and rolling circle amplification methods and specific primers. Eight amplicons (~one kb in length for each) were cloned into the pTG vector and sequenced. Phylogenetic analysis showed that eight genomic components of H13 isolate share 72% identities with those of other nanoviruses and 92-97% identities with the genomic components of another SYSaV isolate in GenBank. In order to study the natural host range of SYSaV, symptomatic chickpea, lentil, liquorice (Glycyrrhiza glabra L.) and esfand (Peganum harmala L.) showing yellowing and stunting symptoms were collected and tested in PCR followed by cloning and sequencing of selected segments including DNA-R, DNA-N and DNA-C. Result of sequencing showed that all cloned segments comprised polyadenylation signal. In addition, four plant species are infected with SYSaV. To identify vector(s) of the SYSaV, two aphid vectors of other nanoviruses, Aphis craccivors and Acyrthosiphon pisum were tested for ability of the virus transmission. Result showed that SYSaV are successfully transmitted by both aphids. However, it seems that A. pisum is the main vector of the virus since sophora (the main host of the virus) is not a suitable host for A. craccivora. Based on the results of this study, SYSaV is one of the nanoviruses infecting legumes in Iran.
Keywords
Legumes, Nanovirus, Aphid transmission, Sophora