وقوع ویروئید کوتولگی رازک در درختان نارنگی سیاهو (Citrus reticulate cv. Siyahoo) در استان هرمزگان

کد مقاله : 2010-23IPPC
نویسندگان
1بندرعباس، بلوار امام خمینی، نبش خیابان طلوع، مرکز تحقیقات و آموزش و منابع طبیعی هرمزگان
2استاد و عضو هیئت علمی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
3مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان
4استان فارس-زرقان-مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان
چکیده
طی سال 1396 با بازدیدهای انجام شده از درختان نارنگی سیاهو که دارای علایم زوال و زردی بودند، در برخی از درختان، علایم شدید ساقه آبله‌ای معکوس (Inverse pitting) در قسمت طوقه و تنه‌ی اصلی مشاهده شد. با توجه به نوع علایم، این درختان از نظر وجود ویروئید کوتولگی رازک (Hop Stunt Viroid (HSVD)) مورد بررسی قرار گرفتند. به همین منظور از برگ و طوقه پنج درخت دارای علائم شدید در باغ‌های مختلف منطقه نمونه برداری انجام و استخراج آر‌ان‌ای با کمک محلول RNX-Plus (سیناکلون، ایران) صورت گرفت. برای ردیابی ویروئید کوتولگی رازک از آزمون واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با نسخه‌برداری معکوس (RT-PCR) با آغازگرهای اختصاصی HSVDf و HSVDr استفاده شد. در الکتروفورز محصول RT-PCR روی ژل آگارز، قطعه مورد انتظار 300 جفت بازی در تمام نمونه‌های طوقه و سه عدد از نمونه-های برگی مشاهده شد اما، در نمونه‌های مربوط به گیاه سالم و نمونه کنترل منفی (آب سترون) قطعه مورد نظر تکثیر نشد. به منظور تایید شناسایی، یکی از نمونه‌های مثبت مربوط به طوقه درختان نارنگی دارای علائم تعیین توالی شد. جستجو با برنامه‌ی بلاست با استفاده از توالی ویرایش شده نشان داد که این توالی با توالی‌ متناظر آن در جدایه‌های ویروئید کوتولگی رازک (رس شمارهای KX156935، AF131249 و AF213487) 97 درصد شباهت دارد. HSVD عامل بیماری کاچکسیا در درختان مرکبات است که علایم رنگ پریدگی، چسبندگی و قهوه‌ای شدن آوندهای آبکشی گیاه، ترک خوردگی پوست و ساقه آبله‌ای را در این درختان ایجاد می‌کند و می‌تواند باعث خسارت اقتصادی در مرکبات حساس نظیر نارنگی ‌شود. این اولین گزارش از وقوع ویروئید کوتولگی رازک به عنوان عامل بیماری کاچکسیا در درختان نارنگی سیاهو در استان هرمزگان است.
کلیدواژه ها
موضوعات
 
Title
Occurrence of Hop Stunt Viroid infecting mandarin (Citrus reticulata cv. Siyahoo) in Hormozgan province
Authors
siavash samavi evazi, Heshmatoallh Rahimian, mohsen amiri mazraie, Mohammad Mehdi Faghihi, Majeed Askari Seyahooei, Abdoolnabi Bagheri
Abstract
Siyahoo district in Hormzgan province is known as one of the most important citrus producing areas of Iran. Siyahoo mandarin is a popular variety of mandarin (Citrus reticulata) cultivated in this region. During frequent visits in 2017 and 2018, following observed symptoms of Hop Stunt Viroid (HSVD) including severe inverse stem pitting symptoms in trunk and crown tissues of some mandarin trees, we studied existence of the causal agent of the drastic decline of mandarin trees in citrus orchards of Siyahoo. To confirm cachexia viroid (HSVD) infection, leaf and crown samples were collected from five severely symptomatic mandarin trees and the total RNA was extracted using RNX-Plus solution (SINACLON, Iran). The isolated RNA was subjected to reverse transcription (RT) PCR assay with specific primers (HSVDf and HSVDr) to detection cachexia viroid. The HSVD was detected in three leaves and five crown samples of the symptomatic mandarin trees. But, plant samples from symptomless trees was not positive for viroid infection. One of the positive PCR product was directly sequenced and edited. BLASTn search of the sequence showed 97 % identity with sequences of Hop Stunt Viroid (accession no: AF213487, AF131249 and KX156935) obtained from NCBI. HSVD is known as causal agent of the cachexia, an economically important disease of susceptible citrus species such as tangelo and mandarin. Symptoms of the disease is including discoloration, gumming and browning of phloem tissue, wood pitting and bark cracking. To our knowledge, this is the first report of HSVD in mandarin trees in Hormozgan province.
Keywords
HSVd, Citrus, Detection