قارچهای عامل خشکیدگی سرشاخه و قارچهای اندوفیت روی برخی درختان در سیستان و بخشهایی از استان کرمان

کد مقاله : 1977-23IPPC
نویسندگان
1کزمان- زرند- خیابان بهشتی-بهشتی 6 شرقی8 پلاک3-کدپستی7761756887
2جاده بنجار، پردیس جدید دانشگاه زابل
3عضو هیات علمی بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
4عضو هیپت علمی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
چکیده
به منظور شناسایی قارچهای مولد خشکیدگی سرشاخه و قارچهای اندوفیت، نمونه‌هایی از سرشاخه های برخی درختان در سیستان و بخش‌هایی از استان کرمان جمع آوری شدند. از سرشاخه های درختان قطعات کوچک پنج میلی متری تهیه و پس از ضدعفونی سطحی با هیپوکلریت سدیم در محیط کشت PDA کشت داده شدند. از قارچ های رشد کرده در محیط کشت اسلایدهای میکروسکوپی در اسید لاکتیک 50 درصد تهیه گردید. خصوصیات ریخت شناسی ساختارهای قارچی به کمک میکروسکوپ نوری بررسی شدند. برای هر آرایه صفات مربوط به کنیدیوماتا (در صورت وجود)، کنیدیوفور، سلول مولد کنیدیوم و کنیدیومها توسط میکروسکوپ نوری مورد مطالعه قرار گرفتند. استخراج DNA ژنومی به روش CTAB انجام شد. کیفیت و کمیت DNA استخراج شده از طریق الکتروفورز روی ژل آگاروز و اسپکتروفتومتری بررسی گردید. سپس ناحیه ITS (Internal Transcribed Spacers) از DNA ریبوزومی (rDNA) جدایه ها با پرایمرهای ITS1 و ITS4 تکثیر و محصولات PCR تعیین توالی شدند. توالی‌های بدست آمده با سایر توالی‌های مرتبط و مشابه در بانک ژن مقایسه گردیدند. در مجموع با داده های حاصل از بررسی خصوصیات ریخت شناسی و توالی یابی نوکلئوتیدی ناحیه ITS-rDNA، دو گونه از جنس Neoscytalidium شامل N. dimidiatum (روی Ficus religiosa، Nerium oleander، Prunus armeniaca) و N. novaehollandiae (روی Morus alba) از درختان دارای علایم خشکیدگی سرشاخه جداسازی شدند. علاوه بر این چهار گونه از جنس Alternaria شامل A. alternata (روی Citrus reticulata، Juglans regia، Prunus dulcis)، A. consortialis (روی Nerium oleander، Prunus dulcis، Vitis vinifera)، A. malorum (روی Prunus armeniaca) و A. tenuissima (روی Citrus sinensis) و دو آرایه قارچی دیگر شامل Fusarium proliferatum (روی Citrus paradisi، Elaeagnus angustifolia، Prunus persica) و Sarocladium strictum (روی Salix aegyptiaca) به عنوان قارچهای اندوفیت سرشاخه ها شناسایی گردیدند.
کلیدواژه ها
موضوعات
 
Title
Fungi causing dieback and endophitic fungi on some trees in Sistan and parts of Kerman province
Authors
Somayeh Rahmani dehnavi, Mohamad Salari, naser panjekeh, mahdi pirnia
Abstract
In order to identify fungi causing dieback and endophitic fungi, samples were collected from shoot tips of some trees in Sistan and parts of Kerman province. From shoot tips of trees, small pieces with the size of five mm cultivated in Patato Dextrose Agar (PDA) after surface disinfection by sodium hypochlorite. Microscopic slides prepared from fungi growing in culture medium in lactic acid 50%. Morphological characters of fungal structures were examined using light microscopy. A combination of morphological features including conidiomata (if present), conidiogenous loci, shape, size and septation of conidia and conidiophores have been used to identify the taxa. Extraction of genomic DNA performed based on CTAB method. Quality and quantity and of extracted DNA investigated through agarose gel electrophoresis and spectrophotometry. Then ITS region of the ribosomal DNA amplified using ITS1 and ITS4 primers and PCR products were sequenced. Sequences of taxa compared with other correlate and similar sequences in Gene Bank. With morphological data and nucleotide sequencing of ITS-rDNA region, two species of the genus Neoscytalidium including N. dimidiatum (on Ficus religiosa, Nerium oleander, Prunus armeniaca) and N. novaehollandiae (on Morus alba) were isolated from trees with dieback symptoms. Furthermore, four species of the genus Alternaria including A. alternata (Citrus reticulata, Juglans regia, Prunus dulcis), A. consortialis (on Nerium oleander, Prunus dulcis, Vitis vinifera), A. malorum (on Prunus armeniaca) and A. tenuissima (on Citrus sinensis) and two other taxa including Fusarium proliferatum (on Citrus paradisi, Elaeagnus angustifolia, Prunus persica) and Sarocladium strictum (on Salix aegyptiaca) are identified as endophitic fungi from shoot tips.
Keywords
Anamorphic fungi, taxonomy, dieback, ITS-rDNA