مقایسه و تعیین روابط فیلوژنی جمعیتهای Heterodera filipjevi در مزارع گندم استانهای اصفهان و چهارمحال و بختیاری
کد مقاله : 1944-23IPPC
نویسندگان
1یاسوج- میدان جهاد- مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی
2دانشگاه تربیت مدرس
3بخش تحقیقات نماتد شناسی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور
4گروه بیماری شناسی گیاهی- دانشکده کشاورزی- دانشگاه تربیت مدرس
چکیده
پنج گونه از نماتدهای سیستی غلات شامل Heterodera avenae type B، H. filipjevi ،H. hordecalis ،H. latipons و Heterodera sp. 1 از مزارع غلات و مراتع مناطق مختلف ایران گزارش شدهاند. بر اساس مطالعات قبلی پیرامون ریختشناسی و ریختسنجی، تنها گونه Heterodera filipjevi از نماتدهای سیستی غلات در دو استان اصفهان و چهارمحال و بختیاری انتشار داشت.4/56 درصد نمونه های خاک جمع آوری شده از مزارع گندم استان اصفهان با میانگین جمعیت 6 تخم و لارو سن دوم در گرم خاک به این گونه آلوده بودند. در استان چهار محال و بختیاری نیز 42 درصد نمونه های خاک با میانگین 994 تخم و لارو سن دوم در گرم خاک به این گونه آلوده بودند. این مطالعه با هدف مقایسه و تعیین روابط فیلوژنی جمعیتهای H. filipjevi در مزارع گندم استانهای اصفهان و چهارمحال و بختیاری انجام شد. ناحیه ژنومی ITS-rDNA در دو جمعیت مربوط به استان اصفهان و یک جمعیت از استان چهارمحال و بختیاری با استفاده از آغازگرهای ،TW81 و AB28 توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر شد. همچنین این ناحیه با استفاده از روش RFLP-PCR و آنزیمهای برشیHinf I ,Rsa I و Pst I برش داده شد. سپس الگوی حاصل از هضم آنزیمی در جمعیت ها مورد بررسی و مقایسه قرار گرفتند. مقایسه توالی ناحیه ITS-rDNA ژنومی جمعیتهای مذکور با توالیهای مشابه در بانک جهانی نشان داد، توالی هر سه جمعیت H. filipjevi مورد بررسی با توالیهای ذخیره شده در NCBI، مربوط به جمعیتهای گزارش شده از ایران و دیگر نقاط دنیا 99% شباهت دارند. توالیهای مربوط به سه جمعیت دو استان مذکور و دو جمعیتJX024208 و AF498380 از ایران از نظر فیلوژنی بسیار شبیه به یکدیگر بودند؛ به طوری که در درخت فیلوژنتیکی استنباط شده از ناحیه ITS-rDNA با روش Bayesian، هر سه جمعیت مورد مطالعه با دو جمعیتJX024208 و AF498380 از ایران یک کلاد تشکیل دادند.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Comparison and determination of phylogenetic relationships of Heterodera filipjevi populations in wheat fields of Isfahan and Chahar Mahal va Bakhtiari provinces
Authors
Hadi Karimipour Fard, Ebrahim pourjam, Zahra Tanha Maafi, Naser safaie
Abstract
Five species of CCNs, namely Heterodera avenae type B, H. filipjevi, H. hordecalis, H. latipons and Heterodera sp. 1 were reported from cereal fields and grasslands in Iran. Among these species, H. filipjevi most widely distributed followed by H. latipons and H. avenae type B. Based on previous surveys, H. filipjevi was found in Isfahan and Chahar Mahal va Bakhtiari provinces as the only species of cereal cyst nematodes. In Isfahan province 56.4% of soil samples were contained H. filipjevi with an average population of 6.02 eggs and J2/g of soil and in Chahar Mahal va Bakhtiari province, 42% of soil samples were infested to mentioned species with an average of 994 eggs and J2 per 200g of soil. This study was conducted to compare and determine the phylogenetic relationships of Heterodera filipjevi populations in wheat fields of Isfahan and Chahar Mahal va Bakhtiari provinces. The ITS-rDNA region of two populations belonged to Isfahan province and one belonged to Chahar Mahal va Bakhtiari province was amplified by TW81 and AB28 as forward and revers primers respectively. The PCR products were digested by restriction enzymes Hinf I, Rsa I and Pst I. A Comparison of the ITS-rDNA sequences of Isfahan and Chahar Mahal va Bakhtiari populations indicated approximately 99% similarity with those of the Iranian H. filipjevi and other countries in NCBI. The phylogenetic relationships among the populations were determined using Bayesian method. Analysis also showed low genetic distance between three populations of mentioned provinces in this study and the other Iranian populations (JX024208 and AF498380).
Keywords
Cereal cyst nematodes, Heterodera filipjevi, Identification, Phylogeny