گزارش یک گونه جدید از جنس Epidorylaimus Andrassy 1986 از استان کردستان

کد مقاله : 1791-23IPPC
نویسندگان
1استان اذربایجان شرقی. تبریز. بلوار 29 بهمن دانشگاه تبریز دانشکده کشاورزی گروه گیاهپزشکی
2دانشگاه تبریز، بلوار 29 بهمن، تبریز
3گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه
4گروه گیاهپزشکی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه تبریز
5اردبیل خ فلسطین شرقی 10 قطعه 3489
چکیده
جنس Epidorylaimus در داشتن دم مخروطی شبیه جنس Eudorylaimus بوده و به دلیل بدن نسبتا باریک و بلندتر و عدم وجود hiatus در محل پاپیل‌های جنسی افراد نر و طول دم بلندتر (4 تا 8 برابر عرض بدن در ناحیه مخرج) از آن قابل تشخیص می‌باشد. در این بررسی برای شناسایی مجموعه نماتدها، در سال‌های 94 و 95 از خاک فراریشه درختان گردو در استان کردستان، تعدادی نمونه جمع‌آوری گردید. نماتدها به روش سینی وایت‌هد استخراج و با استفاده از روش دگریسه تثبیت و به گلیسرین خالص منتقل شدند. شناسایی نماتدها پس از تهیه اسلایدهای دائم، بر اساس صفات ریخت‌شناختی و ریخت‌سنجی و با استفاده از میکروسکوب مجهز به لوله ترسیم و کلیدهای شناسایی معتبر صورت گرفت. جهت شناسایی دقیق، بررسی مولکولی و واکاوی تبارزایی نیز انجام شد. پس از استخراج DNA، ناحیه ژنی28S D3/ D2 از rRNA تکثیر و توالی‌یابی گردید. ترسیم درخت تبارزایی با استفاده از نرم افزار Mrbayes،صورت گرفت. بر اساس خصوصیات ریخت‌شناختی و ریخت‌سنجی جمعیت تحت بررسی به عنوانEpidorylaimus sp شناسایی شد. این گونه به دلیل طول بدن (07/1 تا 28/1 میلی‌متر)، بدن نسبتا باریک (ضریب a برابر با 28 تا 37)، دو لوله جنسی در افراد ماده، شکاف تناسلی عرضی و محل آن در وسط بدن تا کمی جلوتر، ناحیه لبی دارای فرورفتگی نسبت به بدن و به عرض 11 تا 14 میکرومتر، طول ادونتواستایلت 5/15 تا 5/16 میکرومتر و دهانه‌ای به اندازه 25 تا 32 درصد طول ادونتواستایل، ادونتوفور 24 میکرومتر، طول مری 281 تا 328 میکرومتر، طول راست‌روده 25 تا30 میکرومتر، آلت نرینه به اندازه 32 میکرومتر و پنج تا هفت پاپیل جنسی شکمی، دم مخروطی بلند (76 تا 99 میکرومتر) با خمیدگی به طرف شکمی، دارای بخش هیالین در انتهای دم به اندازه 32 تا 41 درصد طول دم، از بقیه گونه‌ها قابل تفکیک می‌باشد. در نمونه تحت بررسی برخلاف توصیف جنس،hiatus نیز قابل مشاهده است. جمعیت ماده Epidorylaimus sp از نظر برخی صفات با گونه E. andrassyi، مثل داشتن طول دم کوتاه‌تر (76 تا 99 در برابر 100 تا 116 میکرومتر)، ادونتوفور بلندتر (24 در برابر 5/18 تا 5/22 میکرومتر)، ضریب c بیشتر (7/11 تا 13 در برابر 7/8 تا 1/11) و ضریب V بیشتر (45 تا 51 در برابر 5/38 تا 41) قابل تشخیص است. بررسی‌های مولکولی نیز نتایج حاصل از بررسی ریخت‌شناختی و ریخت‌سنجی را مورد تائید قرار داد و سه جمعیت مشابه این گونه در درخت‌واره تبارزایی یک کلاد جداگانه و نزدیک به گونه E. lugdunensis تشکیل داد. گونه جدید با گونه اخیر نیز از نظر طول بدن، ضریب c و c`و طول آلت نرینه متفاوت است.
کلیدواژه ها
موضوعات
 
Title
A new species of the genus Epidorylaimus Andrassy, 1986 from Kordestan province
Authors
kioumars mireki, Gholamreza Niknam, Habibeh Jabbari, arezoo naghavi, amin fallahi
Abstract
The genus Epidorylaimus, resembles Eudorylaimus in having a conoid tail, but differs from this genus with regard to a comparatively more slender-longer body, much longer (4–8 times the anal body diameters) tail and absence of hiatus in males. In this study, in order to identify the fauna of nematodes, several soil samples were collected from the rhizosphere of Walnut trees in Kordestan province during 2015 and 2016. Nematodes were extracted using the modified whitehead method, fixed by De Grisse method and transferred to anhydrous glycerin. After the preparation of permanent slides, identification of nematodes was performed based on morphological and morphometrical characteristics and using a light microscope equipped with a drawing tube and valid identification keys. Molecular and phylogenetic analysis were also performed for confirmation of the identification accuracy. After the DNA extraction, D2-D3 segment of 28S rRNA gene was amplified and the resulting amplicons were sequenced. The phylogenetic tree was generated using Mrbayes software. Based on morphometrical and morphological data the studied population was identified as Epidorylaimus sp. It is characterized by having a relatively slender (a= 28-37), 1.07-1.28 mm long body, female genital system amphidelphic, vulva transverse, located in the middle of the body, lip region set-off by constriction, 11-14 μm wide, odontostyle 15-16.5 μm long, aperture occupying 25 to 32% of the odontostyle length, odontophore 24 μm long, neck length 281-328 μm, rectum 25-30 μm long, spicules 32 μm long, with 5-7 ventromedian supplements, tail elongate conoid (76-97 μm), ventrally arcuate, with a hyaline occupying 32 to 41% tail length. Despite the original description of the genus, the understudy population having a hiatus. The female of Epidorylaimu sp differs from E. andrassyi in having, shorter tail (76-99 vs 100-116 μm), longer odontophore (24 vs 18.5-22.5 μm), longer neck length (281-328 vs 258-280 μm), greater c (11.7-13 vs 8.7-11.1) and V (45-51 vs 38.5-41) values. The molecular analysis confirmed the results obtained by morphological and morphometrical studies, and three identical populations of the species formed a single clade adjacent to E. lugdunensis, but differs from the latter species in its body length, c, c` values and spicules length.
Keywords
Molecular identification, Nematode fauna, D3/D2 28S