ردیابی و بررسی مولکولی جنس Potyvirus در مزارع سبزیجات استان سیستان و بلوچستان
کد مقاله : 1779-23IPPC
نویسندگان
1خیابان بزرگمهر 1
2گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی، دانشکده بیرجند
چکیده
بیماری های ویروسی از مهمترین عوامل محدود کننده تولید سبزیجات می باشند. چون اکثر ویرسهای گیاهی علاِئمی تقریبا همانند در گیاه ظاهر میسازند ، بنابراین تشخیص آنها از روی علائم کار دشواری است . در این گونه موارد به خواص ذاتی آنها مانند خواص ریخت شناسی ،نوع اسید نوکائیک و ... توجه می شود . Potyvirus ها بیماری های مهمی در محصولات مختلف دنیا ایجاد می نمایند. این جنس در خانواده potyviridae با ژنومssRNA(+) می باشد از شاخصهای اصلی در طبقه بندی این خانواده وجود ناقلین متفاوت میباشد .و این جنس مهمترین جنسهای ویروسی روی محصولات زراعی ، باغی ، زینتی است . طی ماه های فروردین و اردیبهشت سال 1397، به منظور ردیابی و شناسایی Potyvirus های آلوده کننده سبزیجات و علفهای هرز، بازدید هایی از شهرستان خاش منطقه اسماعیل آباد و عباس آباد استان سیستان وبلوچستان به عمل آمد و 90 نمونه تصادفی سبزیجات با علائم مشکوک ویروسی شامل موزاییکی شدن، رگبرگ روشنی و موزائیک خفیف جمع آوری گردید. آلودگی این نمونه ها به ویروس Potyvirus با استفاده از روش های مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. پس از استخراج RNA با استفاده از کیت دنا زیست، آزمون مولکولی با روش RT-PCR و آغازگرهای دژنره مربوط به ناحیه ژن پروتئینی پوششی این ویروس در نمونه های آلوده، قطعه ای به طول 760 جفت باز تکثیر گردید. نتایج حاصل از آزمون PCR نشان دهنده تکثیر ناحیه مورد نظر در سه نمونه از گیاه ریحان (Ocimum basilicum) و یک نمونه علف هرز پنیرک (Malva sylvestris) با Potyvirus بود. به منظور تایید نهایی آلودگی و بررسی های تکمیلی، نمونه ها جهت تعیین توالی به شرکت ماکروژن کره ارسال گردید. بررسی توالی های مذکور درپایگاه بلاست، نشان دهنده آلودگی این ویروس به جنس potyvirus در سبزیجات منطقه می باشد. در بررسی این توالی ها، بیشترین شباهت با گونه Turnip mosaic virus در سطح 90 درصد بود که البته بررسی های تکمیلی برای تایید نهایی گونه با استفاده از سایر مناطق ژنی مورد نیاز است. ردیابی آلودگی های ویروسی به درک زیست شناسی آن ها، دامنه انتشار جغرافیایی آن ها و نیز پتانسیل ظهور آن ها به صورت اپیدمی های جدید کمک می نماید. این اولین گزارش از ردیابی Potyvirus ها در مزارع سبزیجات استان سیستان و بلوچستان است.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Detection and molecular characterization of Potyvirus in vegetable fields of Sistan and Baluchestan province
Authors
mahbube alikhani, Seyyede Atefeh hosseini
Abstract
Plant viruses caused restriction in vegetable fields.Because most plant viruses exhibit symptoms that are almost identical to the plant it is difficult to detect them.in thise cases;their inherent properties . such as morphological properties;the type of nucleic acid ;etc are noted . Potyviruses caused serious diseases in different crops of the world.this genus is in the Potyviridae family with the ssRNA(+) genome. the main characteristics of this family are different carriers and this genus is the most important virus on crops . Due to easily spreading of these viruses detection of such viruses are crucial for control of incited diseases Potyviruses caused important diseases in different crops of the world During April and March 2018, 90 ssmples of vegetables were collected from Khash in Sistan and Baluchestan province. These samples showed mosaic, vein clearing and mild mosaic symptoms. Infection of Potyviruses were investigated by molecular methods. RNA was extracted by kite (Dena Zist) and RT-PCR was performed by degenerated primers and were amplified specific fragment related to Coat protein. 3 samples of Ocimum basilicum and one samples of Malva sylvestris amplified fragment with 760 bp. In order to final confirmation, samples were sequenced by Macrogene company. Investigation of sequences in Blast showed that all samples have similarity with Turnip mosaic virus in 90 % level. Although for final acceptance, complementarities activities are necessary. Detection of viruses is important in understanding of Biology, distribution and epidemiology of them. This is the first detection of Potyvirus in vegetable fields of sistan and baluchestan province
Keywords
: Degenerated primers, Ocimum basilicum, Malva sylvestris