جداسازی و شناسائی مولکولی گونه Ectophoma multirostrata از گیاه زینتی Catharanthus roseus
کد مقاله : 1721-23IPPC
نویسندگان
16163713777
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران.
چکیده
پریوش گیاهی زینتی متعلق به خانواده Apocynaceae است. سه گیاه بیمار پریوش با علائم لکه های کوچک نامتقارن به رنگ قهوه ای با حاشیه تیره روی برگ ها از فضای سبز شهر اهواز جمعآوری گردید. جهت جداسازی بیمارگرهای احتمالی، قسمت هائی از مرز سالم و بیمار برگ آلوده جداسازی و در شرایط سترون آزمایشگاه با استفاده از هیپوکلریت سدیم 2% به مدت دو دقیقه ضدعفونی سطحی و سپس با استفاده از آب مقطر سترون شستشو شد. قطعات برگی با استفاده از کاغذ صافی سترون خشک و روی محیط غذایی سیب زمینی- دکستروز-آگار (PDA) قرار داده شد. سه جدایه قارچی بدست آمده به روش تک اسپور خالص سازی شد. بررسی اولیه ریخت شناسی نشان داد که این جدایه ها متعلق به خانواده Didymellaceae می باشد. جهت شناسایی ملکولی، جدایه های این قارچ در محیط کشت سیب زمینی- دکستروز - بروث (PDB) رشد داده شد. پس از10 روز نگهداری در شرایط تاریکی و دمای 28 درجه سانتی گراد برروی شیکر، زیست توده میسیلیومی با استفاده عبور دادن از کاغذ صافی سترون جمع آوری گردید و سپس در فریزدرایر خشک- انجمادی شد. DNA کل استخراج شد و نواحی ژنی ITS و tub2 به ترتیب با استفاده از آغازگرهای ITS1/NL4 و Btub2Fd/Btub4Rd تکثیر گردیدند. در آنالیز جستجوی BLASTn بر اساس توالی tub2، این جدایهها با استرین های مختلف Ectophoma multirostrata بالاترین شباهت را نشان دادند. یک آنالیز فیلوژونتیکی مبتنی بر دو ناحیه ITS-tub2 انجام شد و در آن هر سه جدایه با سه استرین شناخته شده گونه E. multirostrata ( شامل CBS 110.79، CBS 274.60 و CBS 368.65) خوشه بندی شدند و یک کلاد تکنیائی با ارزش بالای 99% ایجاد کردند. همچنین، بررسی ریخت شناسی دقیق جدایه های تحت تحقیق (شامل شکل و اندازه پیکنیدیومها، پیکنیدیوسپورها و تعداد استیولها) نشان داد که این جدایه ها گونه E. multirostrata هستند. این گونه برای اولین بار از گیاه پریوش گزارش میشود.
کلیدواژه ها
موضوعات
Title
Isolation and molecular identification of Ectophoma multirostrata on ornamental plant of Catharanthus roseus
Authors
reihaneh larki, mehdi mehrabi koushki, reza farokhi nezhad
Abstract
Periwinkle is an ornamental plant belonging to Apocynaceae family. Three diseased Periwinkle plants showing small, asymmetric, brown-colored leaf spot with dark border were collected from greenspaces of Ahvaz. To isolate probable pathogens, the small pieces of leaf were taken from the interface between healthy and diseased tissue and surface-sterilized using 2% sodium hypochlorite (2 min), and then washed with sterile distilled water. Leaf pieces were dried on sterile filter paper and plated on petri dishes containing potato dextrose agar (PDA). Three obtained fungal isolates were purified by single-spore method. Primary morphological study showed that these isolates belong to family Didymellaceae. To molecular identification, fungal isolates were grown in potato-dextrose-broth (PDB) medium. After ten days incubating in darkness at 28 °C on shaker, mycelial biomass were collected by passing through sterile filter paper and then freeze-dried. Total DNA were extracted and then, ITS and tub2 regions were amplified using primer pairs ITS1/NL4 and Btub2Fd/Btub4Rd, respectively. In the BLASTn analysis of the tub2 sequence, these isolates showed the highest identity to different strains of Ectophoma multirostrata. A phylogenetic analysis based on both ITS and tub2 regions was carried out, and on which all three isolates were clustered with three known strains of the species Ectophoma multirostrata (including CBS 110.79, CBS 274.60 and CBS 368.65) and formed a monophyletic clade with strong BS 99% support. The proper morphology of the isolates under study (including the shape and size of pycnidia, pycnidiospores and the number of ostioles) showed that these isolates are E. multirostrata species. This is the first report of E. multirostrata on periwinkle plant.
Keywords
Periwinkle, leaf spot, Phylogeny, ITS, tub2